Университет основан в 1994 году.
В университете проводятся широкие научные исследования. Чтобы повысить эффективность использования научного потенциала, шире привлекать научных работников к выполнению тематики общегосударственного значения, Ученый совет университета определил приоритетные направления научных исследований, среди которых:
- Прогрессивные системы и методы улучшения тягово-скоростных, экономических и экологических свойств автомобилей.
- Обеспечение надежности и системной эффективности автомобилей и дорожных машин за счет разработки и оптимизации методов, моделей и технологий их производства, ремонта и эксплуатации;
- Механика транспортных средств и сооружений.
- Прогрессивные направления развития транспортного строительства в условиях перехода к рыночной экономике.
- Проблемы формирования рациональных транспортных систем и обеспечение эффективного функционирования их составных элементов в условиях рыночной экономики.
- Современные информационные технологии и технические средства в обучении.
В университете углубляется процесс интеграции с академической наукой. Научные работники университета имеют творческие связи с такими ведущими научными учреждениями Национальной Академии Наук Украины как институты: электросварки им. Е. А. Патона, газа, механики, проблем материаловедения, сверхпрочных материалов, общей и неорганической химии воды и др. Ныне творческие связи с научными учреждениями Академии приобретают новое содержание. Свидетельством этого является договор о научно-техническом содружестве между Институтом электросварки им. Е. А. Патона НАН Украины и Национальным транспортным университетом.
В университете работает четыре специализированных ученых совета по защите докторских и кандидатских диссертаций, которые обеспечивают аттестацию научных кадров высшей квалификации для нужд Украины.
В НТУ постоянно издаются три межведомственных сборника: "Проблемы транспорта", "Управление проектами, системный анализ и логистика", "Гидравлика и гидротехника". С 1995 года издается Сборник научных работ Национального транспортного университета, а с 1997 года - Вестник Национального транспортного университета.
Университет поддерживает тесные контакты с родственными вузами, научными центрами стран СНГ, Польши, Германии, Словакии, США и др.
Почти треть студентов принимает участие в научно-исследовательской работе. Полученные результаты исследований студенты используют при выполнении курсовых и дипломных работ. Десятки воспитанников университета стали лауреатами разных студенческих конкурсов, олимпиад, участниками республиканских научных конференций. Наиболее одаренные из них учатся в магистратуре и зачисляются в резерв для поступления в аспирантуру.
При кафедрах университета действуют компьютерные классы. Учебные кабинеты и лаборатории оснащены современными испытательными машинами, стендами, приборами и средствами вычислительной техники. В период обучения и прохождения практики студенты получают рабочие профессии - водителя автомобиля, машиниста дорожных машин, оператора электронно-вычислительных машин и др. Читальные залы и книжный фонд библиотеки полностью удовлетворяют нужды студентов. На учебном полигоне широко представлены автомобили и дорожные машины.
В университете заботятся о физическом развитии студентов, хорошо налажена спортивная работа: есть спортивный комплекс с игровыми и тренажерными залами, плавательным бассейном, пунктами спортивной реабилитации, летний спортивно-оздоровительный лагерь. Работают секции с 18 видов споpта. Наибольшeй популярноcтью пользуетcя мотоcпорт - университетcкая кoманда извеcтная вo вcей Украинe и зa еe предeлами. Тpадиционно проводитcя мeждународный студенчеcкий мотокроc нa пpиз НТУ.